НЦРРЗ е създаден през 1963 г. и е здравно заведение по проблемите на общественото здраве, със статут на научна организация. Негова основна задача е защитата на българското население от вредните въздействия на йонизиращите лъчения. Центърът осигурява контрол на факторите на работната и жизнената среда, за определяне и намаляване на облъчването на лицата от източници на йонизиращи лъчения, дозиметричен контрол за определяне на вътрешното и външното облъчване, оценка на радиационния риск за населението, като цяло или на групи от него.

 Здравният мониторинг на лицата работещи в среда на йонизиращи лъчения е задължителен от 1966 г. и е една от приоритетните задачи в работата на НЦРРЗ. Секция "Медицинска радиологична защита", е единственото диагностично, консултативно и организационно-методично звено по превантивна радиационна медицина и проблемите на радиационната патология в България, съответстващо на европейските стандарти. НЦРРЗ приема за медицински прегледи и изследвания всички случаи на облъчени лица, при радиационни аварии в София и Софийска област, а при необходимост от биологична дозиметрия, обслужва цялата страна. В центъра се провеждат консултации при проблемни случаи, свързани с лъчева патология и при пациенти от цялата страна. Центърът поддържа регистър на диспансерно наблюдаваните лица, на лицата участвали в радиационни инциденти, на трайно и временно изведените от работа в среда на йонизиращи лъчения лица, както и на лъчево увредени пациенти.